Grazie mille per la risposta. Cmq, da qui ho scoperto che con le ultime versioni, Xorg non ha più bisogno di un file di configurazione (xorg.conf): si configura da solo.
Credo che debian utilizzi i driver specifici per la scheda intel (xserver-xorg-video-intel); infatti ho eseguito questo script per testare compiz ed ho ottenuto un messaggio che mi consigliava di aggiornare i driver dai backports. L' ho fatto ed ora compiz funziona.
Ciao