Grazie mille, mi hai dato la spinta giusta, ho studiato un po meglio il comando top, ed ho notato che in fase di "riposo" ovvero solo l essenziale in esecuzione, tutti i parametri sono nella norma, persino il wa che resta a 0% o poco più.

Mentre ho notato che per esempio: facendo una richiesta di visualizzazione di una pagina web al webserver, da un altro dispositivo, come al solito l operazione richiede parecchio tempo per essere portata a termine ed il wa sale sui 90% scendendo gradatamente verso i 50% persistendo sino alla fine del caricamento preciso della pagina web (che impiega svariate decine di secondi).

Dopo di che ho fatto altre prove e mi sono inbattuto nel avvio di un demone che anomalamente non startava, sono arrivato a capire che la causa era nel suo file di configurazione, una volta aperto mi sono ritrovato le prime 3 righe corrette ed una 4 riga di 2350 caratteri il cui significato (aperto con notepad++ su windows via samba) è "null", da nano i caratteri vengono visualizzati come una serie di "^@".

Ora sono di nuovo arrivato ad un punto morto, non ho esperienza per poter affermare la mia teoria e dire che l'hdd sia rotto, ma la corruzione di file e la lentezza generale mi portano solo a chiedervi un programma diagnostico per hdd in printline che salvi in modo "append" i risultati su un file, siccome fin ora il migliore che ho trovato è stato "badblocks" che però salva su file solo al termine, ma il server si blocca e non conclude il processo.

Grazie e scusate per il papiro

Allora, sono sicuro di non aver toccato "/etc/fstab", a parte file di configurazione di pacchetti (come samba ssh proftp ecc) non ho modificato nulla, l'unica aggiunta che ritengo forse pericolosa è stato un demone creato da me, che semplicemente lancia un .jar che ho sempre scritto io (per quello lo ritengo pericoloso) che ogni tot va a scrivere su un sito web esterno, l'ip attuale della mia connessione, praticamente un dns.

L'hdd come file system è formattato in ext4, se è quello che mi chiedevi.

Spazio libero in abbondanza su HDD.

Ram è poca, attualmente gira se mi ricordo bene con 2GB (da sistema ne risultano 1,5 circa, visualizzato dal comando "top" e "free"), in ogni caso un 3/5 è sempre libera.

Ora vi dò le novità che ho riscontrato: mi sono convinto a comprare un nuovo hdd, che in ogni caso avevo bisogno, quindi ho iniziato la copia dei file del HDD "potenzialmente rotto" (il protagonista di questi post) su un altro che invece funziona alla perfezione, la copia è stata fatta da un Ubuntu, dal un fisso decisamente potente, entrambi gli hdd erano collegati via sata3. Per spostare un totale di 100GB ci ha messo ben 3 giorni (24h/24h)!
Ogni tanto andavo a dare un'occhio, la velocità andava intorno agli 800 kb/s, con picchi massimi di 10 mb/s ed minimi di 200 kb/s.

Or ora sto reinstallando il mio debian server sul nuovo HDD arrivato e per ora funziona bene, mi manca solo una prova per definire rotto l'hdd, quando sarò sicuro che i dati che contiene sono inutili e già trasferiti, lo formatterò sotto Winzoz per vedere se la velocità di trasferimento rimane così bassa.

Ringrazio tutti e metterei il post come Risolto, ma potrei scoprire ancora qualcosa di interessante, non sono pratico di forum