avidemux potrebbe fare al caso tuo però io ho avuto dei problemi durante l'installazione (non trova librerie che sono già installate) e ho rinunciato (senza però cercare di risolvere il problema per pigrizia :-P ...).

Io ho realizzato un cd audio "molto artigianalmente" a partire da un dvd semplicemente utilizzando il tool di registrazione suoni di kde. E' sufficiente riprodurre il dvd e avviare contemporaneamente il tool di registrazione (facendo attenzione a settare l'ingresso sull'output della scheda audio); il risultato non è stato malaccio.
Per i ritocchi sulle tracce si può poi usare audacity.

Ciao.